Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKN8

GTF3C4, General transcription factor 3C polypeptide 4, humanhuman

Predictions only

Length 822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C4Q9UKN8 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF3C4Q9UKN8 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.5 ms