Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKL4

GJD2, Gap junction delta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJD2Q9UKL4 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GJD2Q9UKL4 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GJD2Q9UKL4 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms