Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKJ5

CHIC2, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC2Q9UKJ5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC31.3■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC31.29■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC31.28■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.6
CHIC2Q9UKJ5 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC31.25■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC31.22■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC31.21■■■□□ 2.59
CHIC2Q9UKJ5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms