Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKA4

AKAP11, A-kinase anchor protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 1,901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP11Q9UKA4 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AKAP11Q9UKA4 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AKAP11Q9UKA4 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AKAP11Q9UKA4 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AKAP11Q9UKA4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AKAP11Q9UKA4 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AKAP11Q9UKA4 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AKAP11Q9UKA4 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AKAP11Q9UKA4 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
AKAP11Q9UKA4 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AKAP11Q9UKA4 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AKAP11Q9UKA4 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AKAP11Q9UKA4 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AKAP11Q9UKA4 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AKAP11Q9UKA4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AKAP11Q9UKA4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AKAP11Q9UKA4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AKAP11Q9UKA4 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AKAP11Q9UKA4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AKAP11Q9UKA4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AKAP11Q9UKA4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AKAP11Q9UKA4 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AKAP11Q9UKA4 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
AKAP11Q9UKA4 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AKAP11Q9UKA4 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms