Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK80

USP21, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 21, humanhuman

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP21Q9UK80 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
USP21Q9UK80 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
USP21Q9UK80 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms