Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJW0

DCTN4, Dynactin subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN4Q9UJW0 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCTN4Q9UJW0 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCTN4Q9UJW0 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCTN4Q9UJW0 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCTN4Q9UJW0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCTN4Q9UJW0 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCTN4Q9UJW0 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCTN4Q9UJW0 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCTN4Q9UJW0 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
DCTN4Q9UJW0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DCTN4Q9UJW0 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DCTN4Q9UJW0 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DCTN4Q9UJW0 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DCTN4Q9UJW0 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DCTN4Q9UJW0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DCTN4Q9UJW0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DCTN4Q9UJW0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DCTN4Q9UJW0 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
DCTN4Q9UJW0 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DCTN4Q9UJW0 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
DCTN4Q9UJW0 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
DCTN4Q9UJW0 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms