Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIU6

SIX4, Homeobox protein SIX4, humanhuman

Predictions only

Length 781 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX4Q9UIU6 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SIX4Q9UIU6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SIX4Q9UIU6 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms