Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
MBD1Q9UIS9 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
MBD1Q9UIS9 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
MBD1Q9UIS9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
MBD1Q9UIS9 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
MBD1Q9UIS9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MBD1Q9UIS9 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MBD1Q9UIS9 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MBD1Q9UIS9 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
MBD1Q9UIS9 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MBD1Q9UIS9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
MBD1Q9UIS9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MBD1Q9UIS9 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MBD1Q9UIS9 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MBD1Q9UIS9 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MBD1Q9UIS9 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
MBD1Q9UIS9 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MBD1Q9UIS9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
MBD1Q9UIS9 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
MBD1Q9UIS9 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MBD1Q9UIS9 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MBD1Q9UIS9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MBD1Q9UIS9 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MBD1Q9UIS9 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MBD1Q9UIS9 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
MBD1Q9UIS9 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MBD1Q9UIS9 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MBD1Q9UIS9 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
MBD1Q9UIS9 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MBD1Q9UIS9 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
MBD1Q9UIS9 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
MBD1Q9UIS9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MBD1Q9UIS9 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MBD1Q9UIS9 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
MBD1Q9UIS9 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MBD1Q9UIS9 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MBD1Q9UIS9 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MBD1Q9UIS9 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MBD1Q9UIS9 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MBD1Q9UIS9 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MBD1Q9UIS9 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MBD1Q9UIS9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MBD1Q9UIS9 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MBD1Q9UIS9 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
MBD1Q9UIS9 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
MBD1Q9UIS9 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
MBD1Q9UIS9 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms