Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIL1

SCOC, Short coiled-coil protein, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCOCQ9UIL1 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SCOCQ9UIL1 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SCOCQ9UIL1 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SCOCQ9UIL1 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SCOCQ9UIL1 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SCOCQ9UIL1 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SCOCQ9UIL1 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
SCOCQ9UIL1 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCOCQ9UIL1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCOCQ9UIL1 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCOCQ9UIL1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCOCQ9UIL1 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCOCQ9UIL1 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCOCQ9UIL1 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCOCQ9UIL1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCOCQ9UIL1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCOCQ9UIL1 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
SCOCQ9UIL1 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCOCQ9UIL1 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCOCQ9UIL1 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCOCQ9UIL1 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCOCQ9UIL1 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCOCQ9UIL1 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCOCQ9UIL1 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCOCQ9UIL1 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCOCQ9UIL1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SCOCQ9UIL1 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms