Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHP9

SMPX, Small muscular protein, humanhuman

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPXQ9UHP9 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SMPXQ9UHP9 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMPXQ9UHP9 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMPXQ9UHP9 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMPXQ9UHP9 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMPXQ9UHP9 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SMPXQ9UHP9 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPXQ9UHP9 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPXQ9UHP9 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPXQ9UHP9 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPXQ9UHP9 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPXQ9UHP9 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPXQ9UHP9 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPXQ9UHP9 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPXQ9UHP9 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPXQ9UHP9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPXQ9UHP9 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPXQ9UHP9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPXQ9UHP9 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPXQ9UHP9 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SMPXQ9UHP9 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms