Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRNA9Q9UGM1 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
CHRNA9Q9UGM1 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms