Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CLN8Q9UBY8 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CLN8Q9UBY8 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms