Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PPARGC1AQ9UBK2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PPARGC1AQ9UBK2 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms