Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBE0

SAE1, SUMO-activating enzyme subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAE1Q9UBE0 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SAE1Q9UBE0 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SAE1Q9UBE0 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms