Protein–RNA interactions for Protein: Q9P218

COL20A1, Collagen alpha-1(XX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL20A1Q9P218 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
COL20A1Q9P218 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms