Protein–RNA interactions for Protein: Q9P109

GCNT4, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT4Q9P109 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCNT4Q9P109 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCNT4Q9P109 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCNT4Q9P109 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCNT4Q9P109 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCNT4Q9P109 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCNT4Q9P109 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCNT4Q9P109 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCNT4Q9P109 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCNT4Q9P109 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
GCNT4Q9P109 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCNT4Q9P109 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCNT4Q9P109 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCNT4Q9P109 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GCNT4Q9P109 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCNT4Q9P109 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCNT4Q9P109 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCNT4Q9P109 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCNT4Q9P109 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCNT4Q9P109 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCNT4Q9P109 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCNT4Q9P109 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCNT4Q9P109 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCNT4Q9P109 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCNT4Q9P109 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCNT4Q9P109 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCNT4Q9P109 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCNT4Q9P109 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCNT4Q9P109 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCNT4Q9P109 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCNT4Q9P109 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCNT4Q9P109 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCNT4Q9P109 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCNT4Q9P109 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GCNT4Q9P109 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCNT4Q9P109 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCNT4Q9P109 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCNT4Q9P109 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCNT4Q9P109 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCNT4Q9P109 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCNT4Q9P109 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCNT4Q9P109 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCNT4Q9P109 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCNT4Q9P109 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCNT4Q9P109 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCNT4Q9P109 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCNT4Q9P109 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCNT4Q9P109 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCNT4Q9P109 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCNT4Q9P109 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCNT4Q9P109 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GCNT4Q9P109 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCNT4Q9P109 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCNT4Q9P109 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCNT4Q9P109 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
GCNT4Q9P109 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCNT4Q9P109 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCNT4Q9P109 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCNT4Q9P109 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCNT4Q9P109 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCNT4Q9P109 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GCNT4Q9P109 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GCNT4Q9P109 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GCNT4Q9P109 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GCNT4Q9P109 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GCNT4Q9P109 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
GCNT4Q9P109 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GCNT4Q9P109 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GCNT4Q9P109 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GCNT4Q9P109 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
GCNT4Q9P109 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNT4Q9P109 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNT4Q9P109 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNT4Q9P109 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNT4Q9P109 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNT4Q9P109 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNT4Q9P109 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNT4Q9P109 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNT4Q9P109 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNT4Q9P109 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNT4Q9P109 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNT4Q9P109 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNT4Q9P109 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNT4Q9P109 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNT4Q9P109 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNT4Q9P109 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNT4Q9P109 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNT4Q9P109 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNT4Q9P109 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNT4Q9P109 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNT4Q9P109 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GCNT4Q9P109 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCNT4Q9P109 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCNT4Q9P109 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCNT4Q9P109 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCNT4Q9P109 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCNT4Q9P109 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCNT4Q9P109 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCNT4Q9P109 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GCNT4Q9P109 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms