Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SH3BP4Q9P0V3 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SH3BP4Q9P0V3 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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