Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
ARHGEF12Q9NZN5 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ARHGEF12Q9NZN5 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ARHGEF12Q9NZN5 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ARHGEF12Q9NZN5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ARHGEF12Q9NZN5 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ARHGEF12Q9NZN5 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ARHGEF12Q9NZN5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC31.58■■■□□ 2.65
ARHGEF12Q9NZN5 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ARHGEF12Q9NZN5 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ARHGEF12Q9NZN5 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ARHGEF12Q9NZN5 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ARHGEF12Q9NZN5 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ARHGEF12Q9NZN5 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
ARHGEF12Q9NZN5 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
ARHGEF12Q9NZN5 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.65
ARHGEF12Q9NZN5 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.65
ARHGEF12Q9NZN5 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC31.57■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC31.56■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC31.55■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC31.54■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.54■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC31.53■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
ARHGEF12Q9NZN5 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms