Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZC3

GDE1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1Q9NZC3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
GDE1Q9NZC3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GDE1Q9NZC3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
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