Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYJ7

DLL3, Delta-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DLL3Q9NYJ7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 LINC01960-201ENST00000563759 1884 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
DLL3Q9NYJ7 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
DLL3Q9NYJ7 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms