Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYI0

PSD3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSD3Q9NYI0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSD3Q9NYI0 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSD3Q9NYI0 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
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