Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXE8

CWC25, Pre-mRNA-splicing factor CWC25 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CWC25Q9NXE8 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 UNC50-201ENST00000357765 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CWC25Q9NXE8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CWC25Q9NXE8 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms