Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
FANCLQ9NW38 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FANCLQ9NW38 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FANCLQ9NW38 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FANCLQ9NW38 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FANCLQ9NW38 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FANCLQ9NW38 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FANCLQ9NW38 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FANCLQ9NW38 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FANCLQ9NW38 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FANCLQ9NW38 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FANCLQ9NW38 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FANCLQ9NW38 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
FANCLQ9NW38 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCLQ9NW38 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCLQ9NW38 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCLQ9NW38 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCLQ9NW38 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCLQ9NW38 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCLQ9NW38 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCLQ9NW38 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCLQ9NW38 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCLQ9NW38 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCLQ9NW38 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCLQ9NW38 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCLQ9NW38 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCLQ9NW38 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
FANCLQ9NW38 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FANCLQ9NW38 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
FANCLQ9NW38 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FANCLQ9NW38 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FANCLQ9NW38 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
FANCLQ9NW38 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
FANCLQ9NW38 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms