Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC5

HOMER3, Homer protein homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOMER3Q9NSC5 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
HOMER3Q9NSC5 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
HOMER3Q9NSC5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms