Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSC2

SALL1, Sal-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL1Q9NSC2 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SALL1Q9NSC2 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SALL1Q9NSC2 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms