Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRZ9

HELLS, Lymphoid-specific helicase, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELLSQ9NRZ9 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
HELLSQ9NRZ9 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
HELLSQ9NRZ9 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms