Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRU3

CNNM1, Metal transporter CNNM1, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM1Q9NRU3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CNNM1Q9NRU3 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNNM1Q9NRU3 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms