Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ3

CCL28, C-C motif chemokine 28, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL28Q9NRJ3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 AC007225.1-201ENST00000566331 1836 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CCL28Q9NRJ3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CCL28Q9NRJ3 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms