Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRD9

DUOX1, Dual oxidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUOX1Q9NRD9 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 PRSS3-202ENST00000361005 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 DUSP28-201ENST00000343217 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 ANTXR1-202ENST00000409349 1384 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
DUOX1Q9NRD9 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
DUOX1Q9NRD9 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms