Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BATF3Q9NR55 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms