Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQC7

CYLD, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase CYLD, humanhuman

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYLDQ9NQC7 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CYLDQ9NQC7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CYLDQ9NQC7 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
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