Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
ASCL3Q9NQ33 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
ASCL3Q9NQ33 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms