Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ03

SCRT2, Transcriptional repressor scratch 2, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRT2Q9NQ03 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SCRT2Q9NQ03 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SCRT2Q9NQ03 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms