Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPJ6

MED4, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED4Q9NPJ6 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.3■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.28■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
MED4Q9NPJ6 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MED4Q9NPJ6 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
MED4Q9NPJ6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED4Q9NPJ6 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED4Q9NPJ6 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED4Q9NPJ6 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED4Q9NPJ6 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MED4Q9NPJ6 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED4Q9NPJ6 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED4Q9NPJ6 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED4Q9NPJ6 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED4Q9NPJ6 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED4Q9NPJ6 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
MED4Q9NPJ6 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
MED4Q9NPJ6 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms