Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP58

ABCB6, ATP-binding cassette sub-family B member 6, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 842 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB6Q9NP58 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ABCB6Q9NP58 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ABCB6Q9NP58 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms