Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 EIF4G3-214ENST00000634879 5325 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 MTMR9LP-204ENST00000441044 2624 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ELL3Q9HB65 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ELL3Q9HB65 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms