Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9T3

ELP3, Elongator complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP3Q9H9T3 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ELP3Q9H9T3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ELP3Q9H9T3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms