Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6U6

BCAS3, Breast carcinoma-amplified sequence 3, humanhuman

Predictions only

Length 928 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCAS3Q9H6U6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
BCAS3Q9H6U6 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 PDE9A-212ENST00000398234 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
BCAS3Q9H6U6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms