Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
CLMPQ9H6B4 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CLMPQ9H6B4 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms