Protein–RNA interactions for Protein: Q9H422

HIPK3, Homeodomain-interacting protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIPK3Q9H422 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HIPK3Q9H422 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HIPK3Q9H422 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms