Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S5

RNF39, RING finger protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF39Q9H2S5 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 IP6K2-202ENST00000340879 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 AC007610.2-201ENST00000566770 666 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 AL445228.1-201ENST00000449525 333 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 AC022087.1-201ENST00000558372 612 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 LINC01724-201ENST00000430519 621 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 AL121929.2-201ENST00000609691 1432 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 AC010740.1-201ENST00000417035 684 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 AC114550.1-202ENST00000522661 643 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RNF39Q9H2S5 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms