Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W5

CCDC8, Coiled-coil domain-containing protein 8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC8Q9H0W5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CCDC8Q9H0W5 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 LOXL1-AS1-208ENST00000565756 885 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC8Q9H0W5 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC8Q9H0W5 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms