Protein–RNA interactions for Protein: Q9H089

LSG1, Large subunit GTPase 1 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LSG1Q9H089 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 OR10C1-203ENST00000444197 1672 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LSG1Q9H089 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LSG1Q9H089 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LSG1Q9H089 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LSG1Q9H089 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LSG1Q9H089 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LSG1Q9H089 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LSG1Q9H089 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LSG1Q9H089 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LSG1Q9H089 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LSG1Q9H089 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LSG1Q9H089 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LSG1Q9H089 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LSG1Q9H089 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LSG1Q9H089 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms