Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ7

GFRA4, GDNF family receptor alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA4Q9GZZ7 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
GFRA4Q9GZZ7 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GFRA4Q9GZZ7 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms