Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
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HOXD1Q9GZZ0 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
HOXD1Q9GZZ0 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
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HOXD1Q9GZZ0 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
HOXD1Q9GZZ0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
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