Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CCDC90BQ9GZT6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms