Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT3

SLIRP, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLIRPQ9GZT3 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SLIRPQ9GZT3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SLIRPQ9GZT3 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms