Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LRRCC1Q9C099 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 HAS1-203ENST00000594621 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
LRRCC1Q9C099 AC011484.1-201ENST00000377652 1995 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 208.2 ms