Protein–RNA interactions for Protein: Q9C086

INO80B, INO80 complex subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80BQ9C086 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
INO80BQ9C086 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
INO80BQ9C086 AC244015.2-201ENST00000616358 1861 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms