Protein–RNA interactions for Protein: Q9C035

TRIM5, Tripartite motif-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM5Q9C035 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRIM5Q9C035 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 TOR1B-201ENST00000259339 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 KCNK17-202ENST00000453413 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRIM5Q9C035 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52 ms